市级地方性法规与部门规章冲突，在实际操作中

市级地方性法规与部门规章冲突，应依国务院意见或提请全国人大常委会裁决。根据《立法法》相关规定，冲突解决需国务院提出意见，或决定适用地方性法规，或提请全国人大常委会裁决。未及时处理可能导致法律适用混乱，影响法治统一和权威。
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市级法规与部门规章冲突，需裁决。具体操作：1.初步判断冲突性质，收集相关法规、规章及案例；2.咨询国务院法制机构，获取其意见；3.若国务院决定适用地方性法规，则按此执行；4.若国务院提请全国人大常委会裁决，则准备相关材料，参与裁决过程，并根据裁决结果执行。
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解决市级地方性法规与部门规章冲突，常见方式为国务院提出意见或全国人大常委会裁决。若冲突明显，可先咨询国务院法制机构意见；若国务院无法决定，则应依法提请全国人大常委会进行最终裁决。